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Oligo

Oligo  7官方版

二維碼
  • 軟件授權: 共享軟件
  • 軟件大?。? 2.20 MB
  • 軟件評分:
  • 軟件類型: 國外軟件
  • 更新時間: 2024-12-23
  • 應用平臺: Mac OS 9
  • 軟件語言: 簡體中文
  • 版      本: 7官方版

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軟件介紹 相關專題 常見問題 其他版本 下載地址

基本簡介
Oligo段首LOGO
Oligo官方版是款設計行業中經常使用到餓引物設計軟件。Oligo正式版主要用于核酸序列引物分析設計,可同時計算核酸序列的雜交溫度(Tm)和理論預測序列二級結構。并且Oligo還具備基于最近鄰熱力學數據,低聚糖的搜索算法尋找最佳引物PCR,包括TaqMan、高度多路復用,共識或簡并引物。

Oligo截圖

注意事項:

有時候在mac軟件的下載安裝中會遇到報錯,現在華軍小編來給大家整理較為常見的報錯情況并做出解答,有遇到報錯的朋友可以參考如下方案:

1、“xxx軟件已損壞,無法打開,你應該將它移到廢紙簍”

2、“打不開xxx軟件,因為Apple無法檢查其是否包含惡意軟件

3、“打不開...軟件,因為它來自身份不明的開發者”

解決方案如下:

1、在自己的Mac電腦設置開啟任何來源

2、如果開啟任何來源無法解決報錯的情況,則表明該應用受到蘋果針對應用未簽名的限制,需要通過執行命令行代碼來繞過應用簽名認證。 執行命令繞過ios的公證Gatekeeper

3、如果上述兩種方法都沒有奏效,那么需要關閉SIP系統完整性保護。

Oligo軟件功能

      1、分析TM和內部穩定性,繪制溶解溫度圖和穩定性圖

      2、給出寡核苷酸的重要相關信息

      3、顯示正向引物、反向引物和當前的OLIGO里潛在的連接物,潛在的二聚物也可顯示出來

      4、分析顯示在選中的正向引物或反向引物中基本的成份和溶解溫度

      5、精確地分析出生物信息軟件中的錯配位點

      6、正向引物和反向引物選中后,能自動產生PCR實驗條件和PCR產物信息

Oligo軟件特色

      軟件的體積方面還是比較的小巧

      而且使用也簡單,直觀的用戶界面

      可以讓用戶更加輕松的完成對軟件的操作

      也可將本地里面的文件進行添加到軟件里面進行試驗

      還可將功能進行快速的操作設置

Oligo使用方法

      1、打開oligo,分別單擊File——New Sequence,在打開的窗口中輸入DNA序列,然后單擊序列上面的勾就OK了。

Oligo截圖

      2、單擊菜單欄的Search——for Primers & Probes...

Oligo截圖

      3、分別單擊 Parameters 和 Ranges 設計引物的參數和范圍。接下來先單擊 Parameters。只需修改引物長度和Tm值的范圍即可,如下方第一張圖。另外因為突變位點是確定的,所以要確定下游引物的位置,如下方第二張圖所示,即固定了3'端的位置(這里筆者是將突變位點處的引物作為下游引物)

Oligo截圖
Oligo截圖

      4、再單擊Ranges,設計范圍如下圖。一般PCR產物長度250——500bp為宜。注:該突變位點在20258bp的位置。

Oligo截圖

      5、單擊Search,如下方第一張圖。跳出搜索結果,如下方第二張圖。

Oligo截圖
Oligo截圖

      6、雙擊上方第二張圖中搜索到的引物,跳出的窗口如下圖,是該對引物的基本信息,包括上下游的位置,長度,Tm值,GC含量,分數等。

Oligo截圖

      7、單擊菜單欄Edit——Reverse Primer,打開下方第一張圖的界面,將3’端第三或第四位的堿基改成錯配(這里是將第四位的堿基G改為A,因為這樣改可以取消下游引物的發夾結構),改好后如下方第二張圖。并單擊第二張圖菜單欄下方的勾。


Oligo截圖
Oligo常見問題

如何導入模板序列?

可以用鍵盤直接輸入序列。

如果序列已經作為TXT文件存在,或其他Oligo不能直接打開的文件格式(如Word文件、HTML格式),可以在相應文件中復制序列后在序列展示窗口粘貼,Oligo會自動去除非堿基字符。

如果序列已經保存為Seq格式或者FASTA、GenBank格式,Oligo就可以直接打開序列文件。

Oligo更新日志

      1. 優化的腳步從未停止!

      2. 更多小驚喜等你來發現~

華軍小編推薦:

在經歷了多次的更新與優化,Oligo變得更加的人性化,也更加的簡單易操作,華軍軟件園小編親測,推薦給大家下載,感興趣的小伙伴還可以下載eZip、Paste、ChemDraw Professional、微信 For Mac手繪思維導圖軟件iMindMap9 For Mac。

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常見問題

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